Identification of Genes and Molecules associated to tomato fruit quality and to the tomato plant response to virus infection. A genomics approach”.

 PLAZO PROYECTO 

2005-2008

PRESUPUESTO 

3.000.000€

SOCIOS

Instituto de Biología Molecular y Celular Plantas, Sistemas genómicos , EELM

FINANCIACIÓN 

Genoma España

EXPEDIENTE 

GE; 2005-2008.

LIDER DEL PROYECTO

Antonio Garnell, IBMCP

OBJETIVO GENERAL

Se propuso la secuenciación de hasta 10x el genoma de una entrada (TO 468) de S. pimpinellifolium que había sido propagada por autopolinización durante muchas generaciones por el EELM. El ensamblaje y alineamiento de las secuencias obtenidas se hizo contra la secuencia molde de S. lycopersicum mediante los programas actualmente utilizados en el ensamblaje de S. lycopersicum y en el que participan los solicitantes. La anotacion se realizó siguiendo los criterios y programas establecidos por el ITAG (International Tomato Annotation Group) del que tambien participamos activamente.

OBJETIVOS ESPECÍFICOS

Por parte de Sistemas genómicos se secuenció el cromosoma 8 del genoma del tomate mediante la tecnología combinada Solid y 454 Titanium

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