Sistemas Genómicos utiliza la técnica de última generación droplet digital PCR (ddPCR) para la localización de mutaciones vinculadas a determinadas enfermedades tumorales.
Con esta técnica, nuestros laboratorios detectan de forma precoz con una alta precisión y sensibilidad, con la capacidad para cuantificar variantes presentes en baja frecuencia:
75% (NRAS), 60% (KRAS) y 80% (BRAF) de mutaciones asociadas a Cáncer Colorrectal
90% (EGFR) de mutaciones asociadas a Cáncer de Pulmón
80% (BRAF) de mutaciones asociadas a Melanoma
Aplicaciones clínicas
Detección y cuantificación de variantes más frecuentes en muestras parafinadas de tumor somático (pulmón, melanoma y colorrectal), relevantes para la selección de la farmacoterapia óptima para el paciente en el momento inicial de diagnóstico.
Seguimiento del estado de remisión del tumor mediante la detección periódica de la variante identificada en el momento del diagnóstico, a partir de muestras parafinadas.
Características de la técnica ddPCR
La técnica se basa en la amplificación clonal mediante PCR sobre una partición de la muestra. El sistema divide las muestras de ácidos nucleicos en hasta 20.000 gotas, quedando en cada una de ellas como máximo una única molécula de ADN molde. Cada gota actuará como un contenedor individual para la reacción de amplificación. A continuación, el sistema transforma la señal analógica obtenida en señal digital según presencia o ausencia. Por último, el resultado vendrá expresado en porcentaje o ratio de ADN portador de la variante objeto de estudio con respecto al ADN wildtype.
Sencillez: simplificación de la cuantificación absoluta de copias de ADN portadoras de la variante objeto de estudio.
Precisión: la división en gotas de la muestra permite la cuantificación de pequeñas diferencias en el número de copias de la secuencia diana de ADN.
Sensibilidad: aumenta la relación señal/ruido gracias al enriquecimiento de las moléculas de ADN molde sobre el ADN background; así se alcanza una sensibilidad elevada en la detección de secuencias de baja frecuencia (±10%).
Resistencia a inhibidores: permite trabajar con muestras ambientales, muestras degradadas y muestras parafinadas.
Reproducibilidad intra e interensayo: eliminación del sesgo derivado de la amplificación por PCR que permite la cuantificación de diferencias a pequeña escala.
Optimización de recursos de laboratorio: dado que los volúmenes de reacción se encuentran en rango de picolitros-nanolitros, el uso de reactivos y de muestra requerida se ve reducida para cada experimento.
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